JavaScriptはインタプリタ方式のため、気になったスクリプトはそれを開くことで自由に閲覧できます。またFirebugなどを使用すれば、実行中のコードを詳細に調べられます。コーディングのスタイルが好みではないならば、整形ツールで修正することで読みやすくなります。
ライブラリとして配布されているコードも、圧縮されていないならばコードの例として参考になります。たとえばjQueryのコードならば、Download jQueryで「uncompressed」のコードを開くことで、簡単に参照できます。