エディタでCtrl + Shift + Fを押下することで、コードのフォーマットが実行されます。そのときコードが選択されているならば、そのコードのみが、さもなくば全体がフォーマットされます。
【Window → Preferences】の設定において、たとえばJavaならば[Java → Code Style → Formatter]で、フォーマットの書式をカスタマイズできます。
[Indentation]タブの[Tab policy]で、インデントに使用する文字 (タブかスペースか) を選択できます。